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谷粒形状 杂交稻种子的子粒不整齐，有大小、粗细、粒形不一的感觉。而常规稻种子则比较整齐，大小、粗细、粒形一致。
谷粒腹部 杂交稻种子的腹部可见凹状，似成“V”字形。而常规稻种子的腹部呈直线状。
谷壳吻合处 杂交稻种子谷壳吻合度较差，有的种粒留有裂口。而常规稻种子谷壳吻合度好，无裂口并严密结合。
谷尖 杂交稻种子谷粒色泽黄亮，谷尖多呈紫色。而常规稻种子的谷尖无色。
柱头痕迹 此特征不易观察，以前4项特征为主，便可识别。杂交稻种子属异花授粉的产物，取一粒杂交稻种子认真观察，在谷壳内外夹缝中间，可见一点不很明显的小黑点，即柱头痕迹。
